php或javascript中的分层集群

A hierarchical clustering in php or javascript

本文关键字：分层 javascript php      更新时间：2023-09-26

我目前正在从事一个生物信息学的项目，该项目将对药物进行分析，并根据相似模式对结果进行分组。

为此，我使用欧几里得距离和马氏距离等算法。我目前正在使用库Clusterfck，但它非常有限，并且完全不默认生成信息。

我想知道JavaScript或PHP中是否有其他库实现了这些计算

在处理实际数据时，我不建议使用Javascript或PHP。两者都是解释性的，速度较慢，更适合呈现和显示web内容。出于同样的原因，除了clusterfck之外，您可能在Javascript中找不到太多的库。最好使用其他语言进行分析，并使用这些语言来呈现。

但是，我会分享一些其他语言的库:

  • 在scipy中的聚类
  • scipy-cluster，一个scipy的扩展，做类似的事情
  • hac，一个Java实现
  • fastcluster，用于R和Python
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